最近老是遇到配置Python环境的问题，特别是遇到一些小众一点的包，并没有包括在一些IDE里，所以得各种自己搞。这里写几个常用的方法，主要当做备忘录。
在做空间计算的时候，即便用了numpy，scipy，虽然对于矩阵运算有了很大的提高。但是并没有对类型地理空间数据进行优化，一般要用一个Rtree的算法来减小索引次数，这个算法在Python中有个对应的包。但Rtree需要先装一个叫libspatialindex的包，具体可以去这里下载安装，有种更简单的办法是用brew来装。只用一行命令：
brew install spatialindex
然后去这儿把Rtree下载下来，找到相应目录后安装一下：
python setup.py install
用Brew和Pip这两个工具安装管理个种包还是比较方便的，自己的感觉是安一个IDE，相当于把主流的包都装上，然后再用Brew和Pip安一些自己可能用到但又没有那么常用的包。不过装IDE之后有的会修改默认的Python路径，改成自己的，但卸载后并不会删除这个路径，会导致Python出错，如果有类似的情况，把出错信息Google一下一般会有答案。一般是把~/.bash_profile中的IDE注释掉就行了。
找到一个链接，对于怎么配置说得比较明白：http://matrix.windhunter.net/blog/2012/01/setup-python-env-on-lion-471.html